贷款合同需要分开的原因主要有以下几点：
风险降低：
贷款合同分开可以降低贷款机构的风险。例如，在车贷中，如果车主与贷款人不是同一人，可能会出现断供现象。贷款机构为了确保贷款的安全，会要求车主与贷款人必须是同一人。如果贷款人无法按时还款，银行可以依据合同上的违约处理方式处理车辆。
明确责任：
合同分开有助于明确各方的责任。一式两份的合同，一份由银行保存，一份由贷款人留存。这样，在出现争议或需要查阅合同时，双方都能快速找到相关文件，避免因合同丢失或未携带而引发的麻烦。
合规性：
根据相关法律规定，贷款合同需要一式多份，以满足各方的要求。例如，有些情况下需要提供给中间方或监管机构留存。这样可以确保合同在签署、执行和监管过程中都符合法律法规的要求。
备份与存档：
合同分开还有助于备份和存档。如果合同合在一起，一旦丢失或损坏，可能会给双方带来不便。分开保存可以确保每份合同都有独立的备份，降低因意外情况导致的风险。
综上所述，贷款合同分开主要是为了降低风险、明确责任、符合合规性要求以及便于备份和存档。在签署贷款合同时，建议贷款人务必保留一份合同副本，以备不时之需。
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