在建设厂房时，需要办理以下合法手续：
土地使用权证明
国有土地使用证或集体土地使用证明。
规划许可
建设用地规划许可证。
建设工程规划许可证。
环境影响评估
环境影响评价报告并获得相关批复。
施工许可
建筑工程施工许可证。
建筑质量检验
房屋面积测绘报告书。
竣工验收备案表。
消防审查
根据《消防法》进行消防审查，确保建筑符合消防标准。
其他相关手续
施工图纸审查。
安全生产许可证。
职业病防治审批。
动产产权证或不动产权证。
项目备案。
税务登记证。
根据具体情况可能还需要办理的其他审批或许可，如工商营业执照、个体营业执照等。
请注意，上述手续可能因地区、具体政策和法规的更新而有所变化，建议在具体操作前咨询当地相关部门获取最新信息
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