船舶运输需要交纳的税种包括以下几种：
营业税 ：国内沿海船舶运输业应按"交通运输业"缴纳营业税，税率为3%。房产税和土地使用税
办公场所为有偿承租他人房屋，其房产税和土地使用税由出租方计算缴纳。
对自有的经营用房屋，房产税由房屋产权所有人按照房屋的原值扣除30%后的余值计算缴纳，年应纳房产税=房屋原值×70%×1.2%。
土地使用税按照拥有土地的面积乘以适用税额标准计算缴纳。
印花税：
根据《中华人民共和国印花税暂行条例》，在境内书立、领受应税凭证的单位和个人应缴纳印花税。印花税的应税凭证包括货物运输合同等十三种，企业可按实际发生的应税凭证贴花完税或汇总缴纳。
车船税：
企业自有船舶应按《中华人民共和国车船税暂行条例》及其实施细则规定缴纳车船税。
城建税：
内资公司应按实际缴纳的营业税税额分别乘以规定的税（费）率（7%、5%或1%）计算缴纳城建税，以及教育费附加（3%）和地方教育附加（1%）。
船舶吨税
自中华人民共和国境外港口进入境内港口的船舶，应当依照《中华人民共和国船舶吨税法》缴纳船舶吨税。吨税的税目、税率依照《吨税税目税率表》执行，设置优惠税率和普通税率。
吨税按照船舶净吨位和吨税执照期限征收，应纳税额根据船舶净吨位乘以适用税率计算。
增值税
一般纳税人水路货物运输服务的增值税税率为9%。
小规模纳税人水路货物运输服务的增值税税率为3%。
建议：
船舶运输企业应详细了解并遵守相关税收法规，确保合法合规经营。
结合企业实际情况，合理规划税务筹划，以降低税负。
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